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按手術有菌或無菌的程度，手術間可劃分成以下5類：
（1）Ⅰ類手術間：即無菌凈化手術間，主要接受顱腦、心臟、臟器移植等手術。
（2）Ⅱ類手術間：即無菌手術間，主要接受脾切除手術、閉合性骨折切開復位術、眼內手術、甲狀腺切除術等無菌手術。
（3）Ⅲ類手術間：既有菌手術間，接受胃、膽囊、肝、闌尾、腎、肺等部位的手術。
（4）Ⅳ類手術間：即感染手術間，主要接受闌尾穿孔腹膜炎手術、結核性膿腫、膿腫切開引流等手術。
（5）Ⅴ類手術間：即特殊感染手術間，主要接受綠膿桿菌、氣性壞疽桿菌、破傷風桿菌等感染的手術。
按不同專科，手術間又可分為普外、骨科、婦產科、腦外科、心胸外科、泌尿外科。燒傷科、五官科等手術間。
由于各專科的手術往往需要配置專門的設備及器械，因此，專科手術的手術間宜相對固定.
一個完整的手術室包括以下幾部分：
① 衛生通過用房：包括換鞋處、更衣室、淋浴間、風淋室等；
② 手術用房：包括普通手術間、無菌手術間、層流凈化手術間等；
③ 手術輔助用房：包括洗手間、麻醉間、復蘇間、清創間、石膏間等；
④ 消毒供應用房：包括消毒間、供應間、器械間、敷料間等；
⑤ 實驗診斷用房：包括X線、內窺鏡、
病理、超聲等檢查室；
⑥ 教學用房：包括手術觀察臺、
閉路電視示教室等；